约翰·塞尔对以往的哲学家,不管其地位多高,常常是否定多于肯定、抛弃多于吸纳。正因如此,对他的归类就成了一大难题。在心灵哲学中,有人认为他是二元论者,他却自认为是生物学自然主义。在他看来,心理现象是自然界的一部分,但又不能还原为物理现象。这似乎很矛盾。但在塞尔看来,关键是要“作出概念上的修改”或“改变范畴”。他说:“问题并不涉及我们对事实的了解,而是涉及我们承袭下来的、用于描述事物的那套范畴。”这些范畴即“心灵”“物质”等。传统的观点认为,它们是相互排斥的。而他认为,只要作一些改变,就会发现它们是一致的,例如只要像他那样既把心灵理解为有主观性等特殊性质的实在,又看作是一种特殊的生物现象。 

　　意向性是他研究得较多也较有成就的一个领域。在他看来,意向性就是心理状态和事件的如下特征,即它们指向、关于、关涉或表征了别的实在和事态。从它与意识的关系来说,有意识的状态不一定都有意向性,如无名的烦恼被意识到了,但没有意向性。而有意向性的状态又不一定有意识。但意识是理解意向性必不可少的环节。从意向性的范围来说,有意向性的心理状态不局限于命题态度,因为只有感受性质而无命题内容的状态也有意向性,如感觉、情感等。从类型上看,意向性有三,即内在的意向性、仿佛的而非内在的意向性、语言的派生的意向性。在意向性的“自然化”问题上,他承认,如果放宽对“自然的”、“物理的”理解,那么可以认为,意向性是一种自然的甚或物理的属性,当然是一种高层次的、类似于表现型的东西。如果说塞尔哲学有对意向性“自然化”的一面,那么这就是他的自然化,因为他通过对“自然”之类的范畴的改铸,为意向性在自然界中争取到了一席之地。据此,他坚决反对流行的自然化哲学,因为他认为意向性本身就在自然之内,属自然现象中的现象,因此用不着根据自然科学术语予以说明。